二甲双胍作为2型糖尿病治疗的一线口服用药而被广泛应用。但在应用时应注意其不良反应，以下是其常见和罕见的不良反应：
胃肠道症状
胃肠道反应是二甲双胍主要的不良反应，常见的症状有腹泻、腹痛、厌食、恶心、呕吐、胃胀、腹部不适、消化不良等。个别患者应用后口中有金属味。极个别会出现消化性溃疡，胃、十二指肠球部炎症。
为减少二甲双胍的胃肠道不良反应，应先从小剂量开始使用，逐渐加至可耐受剂量。推荐餐后或餐中服用，以减少胃肠道刺激。胃肠道方面的不良反应大多可耐受，若引起严重症状时，应立即停药。
皮肤损害及过敏反应
二甲双胍可引起皮肤瘙痒、皮疹、多形性红斑、水泡等。也曾经有剥脱性皮炎、脱发等全身皮损的报道，但罕见。症状较轻时停药后可自愈，若出现皮损应采取相应的处理措施。严重过敏反应导致过敏性休克者极为罕见。
乳酸酸中毒
相对与苯乙双胍，二甲双胍引起乳酸酸中毒的风险极小，但当合并有其它可引起乳酸酸中毒的危险因素时应予注意。合并应用非甾体类抗炎药与利尿剂可增加乳酸酸中毒的风险。
低血糖
单独使用二甲双胍通常不引起低血糖，但在应用二甲双胍时如果有剧烈运动、大量饮酒或空腹饮酒、进食量不足时有可能发生。与其他抗糖尿病药物或胰岛素联合使用时增加低血糖的风险。
血液系统的异常
个别患者长期应用二甲双胍有可能减少维生素B12的吸收，有可能对血液系统产生不良影响，出现巨幼红细胞性贫血，但罕见，必要时可检查血象。
肝损害
二甲双胍有可能导致药物性肝损害，但罕见。在排除其它原因后，对于非酒精性脂肪肝导致的肝酶升高，二甲双胍尚有一定的治疗作用。
因此，认为二甲双胍引起肝功能损害尚缺乏足够的证据。
其它
尚有报道在应用二甲双胍后出现尿频、头晕、头痛、背痛、急性胰腺炎、碱中毒、低镁血症、血管炎、神经精神异常等，均极为罕见。
总体说来，二甲双胍疗效确切、安全经济。必须明确的是，任何药物都有除治疗作用以外的毒副作用，二甲双胍也不例外，且相对于很多药物二甲双胍安全性良好。二甲双胍在2型糖尿病的治疗中发挥至关重要的作用，逾半个世纪的应用积累了大量的经验，其作为一线用药的地位至今未能撼动。为了安全用药，我们在应用任何药物时均应该密切注意可能与药物有关的不良反应，争取使药物副作用降至最低。
